أسباب ضعف إنتاج محطة التحلية من أكثر المشكلات التي تواجه أصحاب المزارع والمصانع والمنشآت السكنية والتجارية في المملكة العربية السعودية، حيث يؤدي انخفاض إنتاج المياه إلى تعطيل الأعمال، وزيادة استهلاك الطاقة، وارتفاع تكاليف التشغيل والصيانة. وتتعدد أسباب ضعف إنتاج محطة التحلية بين انسداد الممبرين، وانخفاض ضغط المياه، وضعف المضخات، وارتفاع